رسالة القسم هي تأهيل صيادلة ماهرين لهم القابيلة العالية على إدخال جميع الخدمات الصيدلانية للمجتمع من خلال العمل في المؤسسات الصحية أو القطاع الخاص في حقل الصناعات الدوائية و غيرها .كما يمكن للصيادلة الخريجين من اتمام دراساتهم العالية للحصول على درجة الدبلوم العالي و الماجستير و الدكتوراة لرفد كليات الصيدلة في القطر بالملاكات التدريسية. 

• يهدف القسم الى تأهيل صيادلة من خلال العمل في  المؤسساته الصحية و كذلك القطاع الخاص.

• التعاون مع المؤسسات الصحية في وزارة الصحة ومصانع الادوية الحكومية و الاهلية في المجالات الصيدلانية.

• اعتماد برامج تطويرية لتعزيز المهارات الشخصية والأكاديمية والتدريسية والبحثية لأعضاء هيئة التدريس لتعزيز القدرات والخبرات نظرية وعملية لديهم .

• التعاون مع كليات الصيدلة على المستوى المحلي وكليات الصيدلة العربية والاجنبية ومراكز الابحاث ذات العلاقة لتبادل الخبرة والمعرفة في المجالات الصيدلانية وذلك لمتابعة التطورات الحاصلة في حقول العلوم الصيدلانية.